Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VGLL3A8MV65 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms