Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM221AA4D161 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms