Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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ARL2-SNX15V9GYD0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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