Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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HCN4Q9Y3Q4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN4Q9Y3Q4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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