Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms