Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms