Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD3Q9UJU5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms