Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD1Q9UIS9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms