Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms