Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHORDC1Q9UHD1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms