Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPC1L1Q9UHC9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms