Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGGBP1Q9UFW8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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