Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UPB1Q9UBR1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms