Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms