Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLRF1Q9NZS2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLRF1Q9NZS2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLRF1Q9NZS2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms