Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDE1Q9NZC3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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