Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC10Q9NYD6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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