Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMTM6Q9NX76 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms