Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDL2Q9NX52 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDL2Q9NX52 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms