Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJC28Q9NX36 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms