Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PARVAQ9NVD7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms