Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms