Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms