Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHST12Q9NRB3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms