Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms