Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms