Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms