Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRIP3Q9BW71 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms