Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms