Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRACR2AQ9BSW2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms