Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms