Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms