Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VRK1Q99986 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms