Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms