Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms