Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms