Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORCS2Q96PQ0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms