Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms