Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC7Q96M83 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms