Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf48Q96LS8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf48Q96LS8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf48Q96LS8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf48Q96LS8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf48Q96LS8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf48Q96LS8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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C2orf48Q96LS8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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C2orf48Q96LS8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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C2orf48Q96LS8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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C2orf48Q96LS8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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C2orf48Q96LS8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf48Q96LS8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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