Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC41A2Q96JW4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms