Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BICD1Q96G01 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms