Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms