Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RNF183Q96D59 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RNF183Q96D59 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF183Q96D59 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RNF183Q96D59 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RNF183Q96D59 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RNF183Q96D59 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RNF183Q96D59 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF183Q96D59 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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