Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMD3Q96D46 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms