Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms