Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTHRC1Q96CG8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms