Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms