Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C6Q969F1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms