Protein–RNA interactions for Protein: Q92841

DDX17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX17Q92841 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX17Q92841 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX17Q92841 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX17Q92841 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX17Q92841 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX17Q92841 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms